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鉴定蛋白domain及绘制蛋白互作网络图
发布时间:2021-03-29 22:05:47 | 浏览次数:

SMART(http://smart.embl.de/)是我们常用来进行domain搜索和蛋白质注释的数据库,它集成了很多蛋白结构预测和功能分析的工具,比如可以预测蛋白的一些二级结构:跨膜区(Transmembrane segments)、复合螺旋区(coiled coil regions)、信号肽(Signal peptides)、蛋白结构域(PFAM domains)等。而此前小编刚好给大家介绍过如何进行单序列或者批量domain鉴定(点击了解一下)。其实通过单序列domian的预测也可以获取该蛋白和其他蛋白的互作关系,进而提取出其对应的蛋白质互作网络。

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